מכשיר הפוליגרף הוא מכשיר אשר קולט תגובות פיזיולוגיות מהגוף של הנבדק, המחובר אליו ע"י אלקטרודות, ומתרגם תגובות אלה לרישומים גרפיים.
התגובות הפיזיולוגיות הנמדדות הן תגובות של מערכת העצבים האוטונומית, ולכן, בניגוד למה שחלקכם חושבים, תגובות אלה אינן ניתנות לשליטה או לשינוי.

בודק פוליגרף מוסמך בוחן את הרישומים הגרפים שהתקבלו ועל סמך זאת מאבחן האם התגובות שהתקבלו מעידות על אמירת אמת או שקר.
אין פה מכשיר שנותן תשובה האם הנבדק משקר או לא על ידי לחיצת כפתור.
ואין מכשיר היודע לנסח שאלות מותאמות אישית לכל נבדק ונבדק.

בדיקת פוליגרף כוללת שיחה מקדימה מעמיקה בין הנבדק ובודק הפוליגרף, בה ישוחחו השניים על כל נושאי הבדיקה וינסחו יחדיו את השאלות אשר תשאלנה בבדיקה עצמה.
לא קיים מצב בו הנבדק מגיע לבדיקה עצמה ואינו יודע מהן בדיוק השאלות אותן ישאל.
לאחר מכן יחבר בודק הפוליגרף את הנבדק המכשיר, וישאל את שאלות הבדיקה.
השאלות תשאלנה מספר פעמים, בכל פעם בסדר אחר, עם הפסקה מפעם לפעם.
הבדיקה אינה כואבת, אולם עלולה להיות כרוכה באי נעימות קלה בשל השרוול של מד לחץ הדם.
בתום הבדיקה ישחרר הבודק את הנבדק, והתשובות תשלחנה למזמין הבדיקה בלבד.

לסיכום יש פה תהליך פסיכופיזיולוגי מורכב המשלב בין בודק פוליגרף מקצועי בעל הכשרה מתאימה, מכשיר פוליגרף תקני והליך בדיקת פוליגרף מלא ומקיף.